A、只含一种元素的物质不一定是单质，例如红磷和白磷组成的混合物中只含有一种元素--磷元素；故A推理不合理；B、化合物是由不同元素组成的纯净物，所以只含一种元素的物质一定不是化合物．故B推理合理；C、构成物质的微粒有分子、原子和离子．故C推理不合理；D、CO和CO2的元素组成相同，但分子构成不同，所以，它们的性质不相同．故D推理不合理；故选B．
