到了秦汉时期，由于内外交通日益发达，“丝绸之路”开通，西域等少数民族地区、南海等边远地区以及东南亚等地的药材源源不断输入内地，并逐渐为内地医家所采用，大大丰富了当时人们的药物学知识。秦汉以来，药物学知识又有了新的积累和发展。西汉初期曾流行过药物学专著，《史记•仓公传》提到的古代医药书中就有《药论》，还有传说的《子仪本草》。用药经验的积累，以及药物学知识的日益丰富，需要专人进行整理和研究。因此，西汉朝廷就已开始召集专人整理、研究和传授本草学。加之秦汉时临证医学的迅速发展，对药物学也要求相应发展，正是在这样的历史背景下产生了《神农本草经》一书。
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