A、一条来自父方，一条来自母方的染色体不一定是同源染色体，只有在减数第一次分裂的前期能够配对的才是同源染色体，A错误；B、同源染色体的形状和大小不一定是相同的，例如X和Y染色体，B错误；C、形状和大小相同的染色体不一定是同源染色体，关键是看在减数第一次分裂的前期能否配对，C错误；D、在减数分裂中配对的两条染色体是同源染色体，D正确．故选：D．
