原生生物是低等生物，通常都是单细胞生物，而且最重要的是它是没有正真成型的细胞核的细胞，它的遗传物质大多是DNA，但是主要集中在一个叫“拟核”的细胞结构当中。而真核细胞就较为高等，而且就有细胞核了，它的遗传物质主要是DNA，集中在细胞核当中，而又少数DNA分布在叶绿体和线粒体当中。所以判定一个细胞是否为真核细胞，最重要是要看它是否有细胞核这一个结构。
细菌和真菌在形态，大小和颜色上有差别。更本差别是真菌有细胞核，而细菌没有。
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