C语言，这道题我很疑惑，望高手进来看看，帮忙解答下！

lz不用烦恼了,你原来的想法是正确的,
第一个问题:
"后面的for语句即：for(j=0;j<2;j++) for(i=0;i<3;i++)最后的输出结果不是三行两列吗"
　的确是三行两列,
把这里的i,j换一下位置就行了,
第二个问题:
如果你要完整的输出的话,就按如上方法改;
你现在改的那个方法,行,但不好看,只适合静态的初始化数据.

void main()
{
int a[2][3],i,j;
printf("Enter data by line :\n");
for(i=0;i<2;i++)
for(j=0;j<3;j++)
scanf("%d",&a[i][j]);
printf("Output a 2-dimension array :\n");
for(i=0;i<2;i++)
for(j=0;j<3;j++) {
printf("%4d\t",a[i][j]);
if(j==2)printf("\n");
}
getch();
}

不要瞎改了，首先原程序没有错，我要提醒的是，你不要总是固化的认为i就是控制行的，j就是控制列的，i，j只不过是两个循环变量，谁控制行谁控制列都可以，这要看你的循环是怎么嵌套的；
再说说你改了以后的那个，你如果这样改的话，也能实现，但是输入与输出就不直观了，最后运行的时候就是，每输入一个数，就输出一个数，输入与输出间隔了，而这个二维数组是要完整的输入，然后再完整输出的；所以，二维数组的输入与输出都输要两个for循环分别控制的；