从航线来看，长江集装箱运输航线主要有渝申(宁)线、宜申(宁)线、汉申(宁)线、皖申(宁)线、湘申线、宁申线。
1．集装箱运输不平衡。因地区经济发展水平的不平衡、集装箱运输设施条件和经济结构的差异，导致长江集装箱运输存在两大不平衡，一是长江集装箱运输基本上是出口大于进口；二是出口以40英尺集装箱为主，而进口以20英尺集装箱为主，以至于20英尺集装箱与40英尺需求的不平衡，空箱调运率居高不下，集装箱运输成本难以下降。
.2货源日益丰富。以粮食、化工品、建筑材料、纸浆和钢材等低值重货为主，以汽车、日用品、家用电器、食品、饮料、白糖、橡胶和瓜果蔬菜等其他货物为辅的货源结构
3运力及港口发展迅速。目前有20多家船公司经营近100条长江干线(包括江海直达航线和近洋航线)集装箱运输航线。如中海、中远、长航、民生和南青等，其中中海的市场份额最大
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