你所表述的并不清晰。所以我不知道你说什么。。。
不过我明白你是欠缺内地的逗留签注。相关签注你可以向香港的中国旅行社(也就是帮香港人办理回乡证的地方)去查询下。因为香港的中旅社除了帮香港人办理回乡证之外,还可以帮居住在香港的内地居民办理签注的续签或者港澳通行证的更换。
所以你尽管前去一问。虽然我没经历过,但是我觉得只要你留学是合法的,再提供下资料,他们应该可以帮你办理签注的。
建议你遵循法律,不要考虑时间和金钱的问题,不要相信中介。否则你会有不良记录风险,那会很麻烦。比如你的第一类情况,出入境印章和证件(护照或港澳证)要对应。建议你问问自己大学里的国际处或学生处。你如果是中国籍,人在香港,建议去中央驻香港公署问问。
去大使馆就好了啊