境外支付服务费代扣代缴增值税的计算方法如下：
1. 确定应纳税额：根据国家规定，境外支付服务费代扣代缴增值税的适用税率为6%。因此，首先需要确定该笔服务费所涉及的金额和数量，并按照6%的比例计算出应纳税额。
2. 计算实际支付金额：在确定了应纳税额之后，需要将其加上原始服务费用得到实际支付金额。例如，如果某项境外支付服务费为1000元，则应纳增值税为60元（1000*6%=60），实际需支付金额则为1060元（1000+60）。
3. 缴纳增值税款项：最后一步是将计算出来的增值税款项缴纳给国家财政部门。通常情况下，在完成相关业务流程时会自动进行代扣和代缴操作，用户只需关注实际付款金额即可。
需要注意的是，在不同地区或行业中可能存在着不同的具体规定和标准，请在使用前仔细阅读相关条款并咨询专业人士以获取更准确、全面、权威之信息。
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