植物进化产生了两类受体，第一类称为模式分子识别受体（patternrecognitionreceptors，PRR），其功能是侦知和识别保守的病原菌模式分子（PAMP）。典型的PRR是寄主的跨膜蛋白质，具有胞外结构域。植物的第二类受体是大多数R基因编码的多态性NBS-LRR蛋白产物，可以侦知和识别病原菌的专化性效应子，启动过敏性坏死反应，抵抗活体寄生物和半活体寄生物的侵染。植物潜在的R基因产物也相当多，例如拟南芥就有150余种胞质NBS-LRR蛋白。R基因产物与匹配效应子需定位在相同的细胞空间，方能发生两者之间的识别。多数植物的R蛋白位于细胞内，匹配的效应子蛋白也被病原菌转运到寄主的细胞质中。锈菌、霜霉菌等依靠吸器而紧密接触寄主细胞质膜，Avr基因产物需输送到吸器外基质，再进入寄主细胞。细菌的效应子依赖Ⅲ型蛋白泌出系统，移出细菌而被注入寄主胞质内。
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